上海開展營業(yè)稅改征增值稅試點前，為解決中國東方航空公司營改增后增值稅計算計算繳納問題，稅務(wù)總局與財政部下發(fā)了《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于中國東方航空公司執(zhí)行總機構(gòu)試點納稅人增值稅計算繳納暫行辦法的通知》（財稅[2011]132號），明確在試點期間中國東方航空公司匯總計算總機構(gòu)及其分支機構(gòu)的應(yīng)交增值稅，抵減分支機構(gòu)已繳納的增值稅和營業(yè)稅后解繳入庫。
　　上海航空有限公司是中國東方航空公司的全資子公司，也屬于營改增試點企業(yè)。由于中國東方航空公司將上海航空有限公司的經(jīng)營業(yè)務(wù)設(shè)定為分公司模式進行管理，上海航空有限公司的銷售收入與進項稅額不匹配，無法單獨核算增值稅應(yīng)納稅額，因此，財稅[2011]132號文只規(guī)定了非試點地區(qū)分支機構(gòu)按照現(xiàn)行規(guī)定申報繳納增值稅和營業(yè)稅。上海市國稅局提出，上航應(yīng)當并入東航匯總計算應(yīng)納稅額，以真實反映企業(yè)的納稅情況，但財稅[2011]132號文對試點地區(qū)的分支機構(gòu)無需單獨納稅沒有專門條款進行表述，希望能進一步予以明確。
　　此外，由于中國東方航空公司提供的分支機構(gòu)名單有誤，財稅[2011]132號文的附件2“中國東方航空公司總機構(gòu)及其分支機構(gòu)名單”中遺漏了中國東方航空股份有限公司云南分公司和中國東方航空股份有限公司濟南飛行運營基地，上海市國稅局也請總局予以增補。
　　鑒于上述原因，稅務(wù)總局制定下發(fā)了《國家稅務(wù)總局關(guān)于中國東方航空股份有限公司增值稅計算繳納有關(guān)問題的公告》，對相關(guān)問題予以明確。由于本公告是對財稅[2011]132號文的補充，也有利于中國東方航空公司準確計稅，減輕稅收負擔，因此將其執(zhí)行日期設(shè)定為2012年1月1日。